Jest to jeden z najstarszych kościołów w Zielonej Górze, którego budowa zaczęła się 1745 roku, kiedy to położono na miejscu budowy kamień węgielny. Budowa trwała 1748 roku i początkowo nie zbudowano wieży, która była przewidziana w późniejszej realizacji. Wieża została zbudowana dopiero w 1828 roku, a na niej zamontowano zegar, który wykonany został w Berlinie.
Kościół początkowo był protestanckim Ogrodem Chrystusowym, a po II wojnie światowej przejęli go katolicy. W kościele, tak jak w sanktuarium na Jasnej Górze w Częstochowie, znajduje się obraz Matki Boskiej Częstochowskiej, który jest odsłaniany przed Mszą Świętą.
W kościele tym na ogromną uwagę zasługują m.in. pochodzące z XVIII wieku: ołtarz główny, chrzcielnica, drewniany prospekt organowy oraz drewniana ambona.